云南省環境監測中心站始建于1974年，是全民所有制社會公益性科研技術事業單位，隸屬于云南省環境保護廳，業務上受中國環境監測總站的指導，是國家環境監測一級站和國家環境監測網成員單位。是云南省環境監測工作的業務技術中心、資料信息中心、網絡中心和培訓中心。

主要承擔云南省行政管轄范圍內的環境質量監測、污染源監測;突發性污染事故及仲裁監測;室內空氣監測及社會委托監測;編寫全省環境質量報告書、環境監測年鑒等各類專題技術報告;全省環境監測網絡的業務組織協調、技術交流和監測人員培訓和環境科學研究;全省有機食品認證管理等，其宗旨是為環境決策管理提供技術支持、為環境執法實施技術監督、為社會經濟建設提供技術服務。

云南省環境監測中心站培養、聚集了一批具有較高學術和技術水平的監測骨干隊伍，現有職工89人，各類專業技術人員76人，其中正高級工程師2人，高級工程師16人，工程師29人。擁有4888M2的辦公實驗樓，共有價值1098萬元的各種監測儀器及輔助設備316臺(套)，其中有氣相色譜/質譜聯用儀、氣相色譜儀、高效液相色譜儀、電感耦合等離子體發射光譜儀、離子色譜儀、原子吸收光譜儀等現代化大型分析儀器。站內設有大氣監測室、水質監測室、物理監測室、生態監測室、技術服務部、綜合室、質量技術管理室、有機食品辦、財務科、行政科和辦公室等11個科室。

云南省環境監測中心站擁有完善的質量保證體系和較強的監測技術能力，可出具準確可靠的監測數據。在國家環境監測總站的多次考核中，均獲得優異成績。在大氣、噪聲、地表水、酸雨等環境要素上相繼成為國家監測網絡成員單位。1994、2000、2003年先后三次通過了由國家質量技術監督局、國家環境保護總局組織的計量認證評審及擴項監督評審，確認本站具備向社會提供水和廢水(含大氣降水和水生物);環境空氣和廢氣;土壤、底質、煤質、固體廢物(含降解塑料);植物、農作物、蔬菜、水產品;噪聲、振動;電磁輻射、電離輻射;機動車排放污染物;室內空氣共八大類242個監測項目的資格(《計量認證合格證書》的編號為(2000)量認(國)字(Ul280)號)。

云南省環境監測中心站經三十年的監測實踐及科研工作，開展了80余個國家、省及國際合作科研項目，其中“昆明三聚磷酸鈉廠環境影響評價研究”、“開遠市區域環境質量評價及綜合防治對策研究”、中美合作“全球內陸降水背景值調查與研究”、“昆河線外向型經濟帶紅河州經濟與環境協調發展規劃”等37項獲得國家、省、地廳級科技成果(或進步)獎。受到國家環保總局和省環保局的多次表彰和獎勵，2002年被國家環保總局授予“‘九五’期間全國環保系統先進環境監測站”光榮稱號。