經國務院批準,，同根同源的原浙江大學、杭州大學、浙江農業大學、浙江醫科大學于1998年9月15日合并組建成為新的“浙江大學”。 原四校校友都成為了新浙江大學的校友，總數達60萬。廣大校友紛紛為母校辦學獻計獻策、牽線搭橋、慷慨解囊, 對學校的建設與發展作出了重要的貢獻。

學校領導和各地校友都十分關心校友會組織的建設。浙江大學校友總會在1999年5月經國家教育部、1999年12月經民政部審查同意重新登記，完成了登記注冊工作。在此基礎上，經過學校領導和各地校友會、廣大校友以及學校各部門、各學院的努力下，新浙江大學首屆校友代表大會暨浙江大學校友總會成立大會于2000年1月16日隆重召開，會議通過了浙江大學校友總會章程，選舉產生了校友總會領導機構，正式宣告浙江大學校友總會成立。2013年4月，經國家民政部評估，浙江大學校友總會被評為AAAA級社會組織。2015年12月，經教育部推薦，被民政部評選為“全國先進社會組織”。

目前，遍布北美、歐洲、澳洲、東南亞、非洲等十幾個國家及國內所有省級行政區域建有151個地方校友會，活躍在全球各地，并越來越成為廣大求是學子在各地的家，充分發揮著凝聚校友、服務母校、回報社會的作用。