中山大學海洋學院于2008年6月成立。學院建設以立足南海，面向國家和地方在海洋科學的深海生物資源、礦產資源和近岸海洋工程與環境領域的重大科技需求，圍繞資源與環境、資源與發展二大主題，重點開展我國深海生物功能基因資源、海洋生物資源保護、海洋地質礦產資源、海洋環境、海洋工程、海洋監測和海洋礦產資源基礎與應用基礎科學研究與技術開發。

中山大學建校之初即開展了海洋科學研究。早在1924年，費鴻年教授就開展了南海近岸漁業資源調查研究。1928年，中山大學農學院院長沈鵬飛擔任領隊，地質學教授朱庭祜先生主持，一行16人乘海瑞號軍艦前往西沙進行實地調查。這是中國歷史上首次有地質學家前往西沙進行科學考察。發表了西沙群島生物資源論文，隨后，西沙群島被國民政治列為中山大學海洋實習基地。

近幾十年來，以林浩然院士為首的水生生物學科在海洋養殖動物繁殖與生長、營養與飼料、病害控制與生態養殖等領域取得了矚目成績，科研成果成功實現產業化并已取得顯著的經濟效益。已故有機化學龍康候先生是中國海洋天然產物化學研究的開拓者與奠基人，曾作為特邀代表出席國際海洋天然產物Gorden會議作大會報告，其摘要刊登在《Science》上，獲得極高的評級。此外，中山大學也是全國最早開辟河口海岸過程與工程、海洋微生物活性天然產物和海洋生物功能基因等學科領域的單位之一，與國際發展基本同步，并已取得了一大批創新成果。中山大學一直重視海洋學科的發展，黃達人老校長提出“中山大學高舉海洋大旗”，并于2008年6月正式成立了海洋學院，2016年5月更名為海洋科學學院。

除了海洋科學學院以外，中山大學涉海學院包括生命科學學院、化學工程與技術學院、地理科學與規劃學院、大氣科學學院、環境科學與工程學院、地球科學與工程學院、海洋工程與技術學院、土木工程學院、中山醫學院、藥學院、國際關系學院、國際金融學院、歷史系、嶺南學院、社會學與人類學學院、管理學院、法學院等；在科技領域建有南海海洋生物國家工程研究中心、河口水利國家地方聯合工程實驗室、南方海洋科學與工程廣東省實驗室（珠海）、廣東省海洋資源與近岸工程重點實驗室、廣東省海洋土木工程重點實驗室、廣東省水生經濟動力良種繁育重點實驗室、廣東省海洋動力與結構安全工程技術研究中心、廣東省海岸與島礁工程技術研究中心、廣東省水環境遙感監測工程技術研究中心、廣東省海洋生物質化工原料及其功能化轉化工程技術研究中心、廣東省熱帶海洋動態防腐材料工程技術研究中心、廣東省河口水利工程實驗室、海洋石油勘探開發廣東高校重點實驗室、海洋微生物功能分子廣東高校重點實驗室等創新平臺；在人文社科領域建有“一帶一路”研究院、粵港澳發展研究院、國家海洋信息中心共建海洋經濟研究中心等研究基地；擁有涉海科研人員1000多人，其中教授/研究員300多人，科研實力雄厚，文化傳承創新活躍，海洋科技創新能力強。