廈門馬拉松由廈門市政府與中國田徑協(xié)會共同主辦，創(chuàng)辦于2003年。比賽規(guī)模由初創(chuàng)時的11998人，發(fā)展到2014年最高峰時77151人同場競技，包含全程、半程、10公里、5公里等共四個項目。后出于安全以及比賽專業(yè)化發(fā)展的考慮，自2015年起嘗試對賽事進行分項和瘦身，將半程、10公里作為配套賽在海滄舉辦。2017年起繼北京馬拉松之后，成為全國第二個僅設(shè)全程項目的專業(yè)化馬拉松，規(guī)模為3萬人，并提前于2016年11月在海滄正式創(chuàng)辦專業(yè)化半程馬拉松賽，規(guī)模為1.8萬人，形成“一城雙賽”格局。

廈門馬拉松創(chuàng)辦以來，一直堅持“政府倡導(dǎo)，市場運作”，堅持“不花政府一分錢”的辦賽模式。在賽事舉辦前幾年，通過配套舉辦兩岸四地邀請賽、馬拉松接力賽、大學(xué)生馬拉松賽等系列賽及舉辦馬拉松高峰論壇、市長論壇、制作馬拉松雕塑并贈送國際奧委會、馬拉松圣火點燃儀式、邀請國家領(lǐng)導(dǎo)人、國際田聯(lián)主席、承辦世界路跑協(xié)會年會等眾多措施，使廈門市和賽事知名度、影響力迅速提升，引領(lǐng)全國馬拉松賽，一度被譽為“北有北馬,南有廈馬”。從2008年起連續(xù)12年榮獲“國際田聯(lián)路跑金標(biāo)賽事”認(rèn)證，并連續(xù)獲中國田協(xié)“金牌賽事”認(rèn)證。廈門也先后被中國田協(xié)授予“中國馬拉松突出貢獻獎”和“馬拉松城市”稱號。