廈門海關始設于1684年，時稱“閩海關廈門口”，至今已有335年的歷史?，F為直屬海關總署的正廳級單位，下設21個職能部門（含副廳級緝私局），14個隸屬單位，10個正處級事業單位；擁有全國唯一的“海峽兩岸農產品檢驗檢疫廈門中心”，共有國家重點實驗室15個、區域性中心實驗室13個?，F有干部職工3027人，離退休人員645人。

業務特點

廈門關區業務管轄范圍包括廈門、漳州、泉州和龍巖4地市，總面積4.42萬平方公里，海岸線長1474公里，進出口總值占福建省8成左右，主要業務指標位居全國海關第9位左右。關區業務門類齊全，現有空港口岸2個、海港口岸3個、開放港區17個，各類海關監管場所78處、海關特殊監管區域4處、陸地港2處，海、陸、空、郵等海關監管業務一應俱全。對臺特色鮮明，監管全國70%的對臺小額貿易業務、1/3的來往臺灣地區旅客，是大陸最大的臺灣水果、水海產品進口地，對臺關務合作走在全國海關前列。