深圳市水務局作為市政府主管全市水行政工作的組成部門，主要職能是負責全市水資源的開發(fā)利用和保護、防洪排澇、供水、節(jié)水、排水、水土保持、水污染防治、污水回用、中水利用、海水利用等。指導區(qū)街水務工作，負責全市水務企業(yè)的行業(yè)管理。局機關設8個處室，管理3個行政管理類事業(yè)單位，1個行政執(zhí)法機構，13個局屬事業(yè)單位。根據(jù)《中共深圳市委深圳市人民政府關于印發(fā)〈深圳市人民政府機構改革方案〉的通知》(深發(fā)〔2009〕9號)，設立深圳市水務局(簡稱市水務局)，為市政府工作部門，由市人居環(huán)境委歸口聯(lián)系。

(一)貫徹執(zhí)行國家、省、市有關水行政工作的法律、法規(guī)、規(guī)章和政策;起草有關法規(guī)、規(guī)章，擬訂相關政策，經(jīng)批準后組織實施。

(二)擬訂水務發(fā)展規(guī)劃及水資源、防洪排澇、農(nóng)田水利、供水、排水、節(jié)水、水土保持、污水處理及回用、中水利用、海水利用等專業(yè)規(guī)劃，經(jīng)批準后組織實施。

(三)承擔生活、生產(chǎn)經(jīng)營和生態(tài)環(huán)境用水保障責任。實施水資源的統(tǒng)一監(jiān)督管理;根據(jù)全省水資源分配方案，做好跨境水資源規(guī)劃銜接工作;發(fā)布全市水資源公報。

(四)負責水資源保護工作。組織水功能區(qū)的劃分，并監(jiān)督實施;監(jiān)測河道、水庫的水量，檢測其水質(zhì)，核定其水域納污能力，提出限制排污總量的意見，并協(xié)助做好水源保護工作。

(五)參與全市水污染治理和水環(huán)境保護政策、規(guī)劃的擬訂工作，承擔水污染治理工程和水環(huán)境保護工程的建設管理和運行監(jiān)管責任。

(六)承擔城市供水水質(zhì)安全責任。負責水務企業(yè)的行業(yè)管理，負責水務行業(yè)的特許經(jīng)營管理;負責管道直飲水的管理以及原水、供水水質(zhì)日常檢測和管理工作。

(七)承擔水務工程的建設管理及其質(zhì)量和安全的監(jiān)督管理責任;負責河道工程修建維護費的征收管理工作;負責政府投資水務固定資產(chǎn)的監(jiān)管及水務發(fā)展專項資金的業(yè)務管理工作。

(八)按照分級管理原則，負責全市水庫、河道、堤防、河口灘涂、滯洪區(qū)及其他水務設施的監(jiān)督管理;負責全市大、中、小型水庫、河道、滯洪區(qū)及其他水工程設施的防洪防風安全;負責水工程范圍內(nèi)建設項目審批。

(九)負責防治水土流失。組織協(xié)調(diào)水土流失的綜合防治、監(jiān)測預報并定期公告;負責審批并監(jiān)督實施建設項目水土保持方案。

(十)負責節(jié)約用水工作。擬訂節(jié)約用水政策及有關標準，指導和推動節(jié)水型城市建設工作。

(十一)承擔全市排水設施(含污水處理設施)的建設管理責任。負責對全市排水運營單位監(jiān)督考核;負責污水處理費的征收管理工作;制定運營服務費的支付標準。

(十二)負責水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法，調(diào)解水事糾紛。

(十三)承辦市政府和上級部門交辦的其他事項。