延慶縣衛生局是全縣衛生工作的主管部門，擔負著全縣的醫療、預防、保健、急診搶救、健康教育等工作，主要包括貫徹執行國家和北京市衛生工作方針政策，制定本地區衛生發展規劃并組織實施;對執業醫師、執業護師、鄉村醫生的資格進行審批并監督管理;審批醫療機構，發放醫療機構執業許可證;審批發放衛生許可證、職業人員健康合格證;對供水、供水的設備、用品、場所、設施進行衛生監督;貫徹獻血法，審批臨床及急診搶救用血;推進新型農村合作醫療工作，制定社區衛生服務規劃;對母嬰保健工作實施監督管理和分類指導;預防、控制和消除傳染病的發生、傳播與流行;對食品生產和經營者進行食品衛生監督;貫徹落實國家關于愛國衛生運動方面的方針、政策，積極開展農村改水改廁和市級衛生村創建工作。